1956年9月，中央音乐大学在全省音乐艺术高校中，率先构建了音乐学系(MusicologyDepartment)。经过60余年的辛劳耕耘，音乐学系在学科建设上已然产生了一套相对完整的教学体系和相对雄厚的学术力量。1982年，国务院学位委员会批准中央音乐大学音乐学学科为硕士学位授权点；1988年今日网校，被批准为博士学位授权点。中央音乐大学音乐学系在音乐学学科的专业设置、课程结构、师资队伍、学术研究、人才培养等各个方面，一直站在全省音乐学学科建设与发展的前列，是中国音乐学学科教学和研究的一个重要基地。

音乐学系目前已完善了中国传统音乐、中国少数民族音乐、中国唐代音乐史、中国近现代音乐史、西方音乐史、世界民族音乐、音乐美学、中国音乐美学史、音乐心理学、音乐文献翻译（法语）、专业音乐教育学、音乐编辑与出版、琴学研究及音乐艺术管理等14个专业研究方向，设置了中国传统音乐、中国音乐史、西方音乐史、世界民族音乐、音乐美学、音乐理论共同课、音乐艺术管理等7个教研室，另设有中央音乐大学于润洋音乐美学史学研究中心、多媒体教学工作室、佛教音乐文化研究室、音乐心理学研究室、民族音乐科学技术实验中心、世界钢琴独奏实习中心、探戈音乐研究中心等7个教研实践中心，以及中央音乐大学远程音乐教育大学认证教室。

音乐学系肩负着全院中学生所有音乐学理论与实践的选修课与必修课，如今各专业所开办课程总和已达140余门。在这种理论课程中，许多在国外属惟一开办。所有主干课程（含中国传统音乐、中国音乐史、西方音乐史、音乐美学、世界民族音乐、音乐艺术管理）均具有多媒体教学的能力。音乐学系所培养的音乐学专业的中学生包括本、硕、博三个层次。最高层次结业生的要求是应全面把握本研究方向的理论与技巧，熟悉学科前沿动态，学术视野开阔，具有跨学科思维，具有探求、发现和解决社会重大现实问题的意识，具备从事本专业理论研究所需的音乐实践能力、学术辨别能力、学术创新能力、国际交流能力与教育教学能力。

中央音乐大学音乐学系班主任多年来在科研上付出了艰难的劳动，也取得了丰硕的成果，从建系至今已出版和发表的著作、教材和论文近万部（篇），许多研究成果弥补了国外外音乐学学科建设的空白，并被全省其他艺术高校所采用，在音乐学专业的教学和研究上，正从过去的“中西合璧”的格局向更加宽广的“中国与世界”的格局发展。

现任系所长为：第一任系院长为张洪岛院士（1956-1983）；第二任系院长为蓝玉崧院士（1983-1987）；第三任系院长为黄晓和院长（1987-1990）；第四任系院长为钟子林院长（1990-1994）；第五任系院长为袁静芳院长（1994-2001）；第六任系院长为张伯瑜院长（2002-2011）；第七任系院长为周青青院士（2011-2016）；第八任系院长为安平院士（2016年至今）。

享受国务院政府特殊津贴的院士有：于润洋、汪毓和、袁静芳、黄晓和、田联韬、钟子林、陈自明、张前、张洪模、陈宗群、徐士家、潘必新、王次炤、李应华、梁茂春、戴嘉坊。

音乐学系现有院士21名（含特聘院士2名），副院长6名；博士生指导班主任27名，硕士生指导班主任33名（含博士生导师）；另有研究员2名，编审1名，译审1名，讲师8名，助教2名。外籍班主任2名，外聘班主任12名。

2023年，音乐学系在校中学生共335人，其中大专生183人（音乐学专业86人，艺术管理专业97人）；硕士研究生110人，博士研究生42人。

音乐学系学术秘书傅潇、辅导员万鲲、教学行政秘书邓雪。