学校创办于1934年，时名湖南国医专科学校，1960年改办为普通高等本科院校湖南中医学院，1990年原湖南科技大学成建制并入湖南中医学院，2002年湖南省中医药研究院与湖南中医学院合并，2006年经教育部批准更名为湖南中医药大学。2012年学校进入一本招生序列。目前学校与湖南省中医药研究院实行校院合一的管理体制。
学校构建了以医学学科为主体，医、理、工、管、文等学科门类协调发展的学科体系。拥有中医学、中西医结合2个博士后科研流动站。现有一级学科博士学位授权点1个，二级学科博士学位授权点14个；一级学科硕士学位授权点4个，二级学科硕士学位授权点24个；获评6个二级学科自主设置博士学位授权点，14个二级学科自主设置硕士学位授权点。

根据《教育部关于同意贵阳医学院更名为贵州医科大学的函》，省政府近日下发通知，就建立贵州医科大学有关事宜通知如下：
　　一、贵阳医学院更名为贵州医科大学，同时撤销贵阳医学院建制。贵州医科大学系多科性本科学校，实行党委领导下的校长负责制。
　　二、贵州医科大学以本科教育为主，同时承担研究生培养任务。重点培养服务区域经济社会发展所需的应用型、技术技能型、复合型人才，全日制在校生规模暂定为17000人。
　　三、贵州医科大学现有专业结构调整和新专业增设，按教育部有关规定办理。
　　四、省教育厅为贵州医科大学主管部门，要加强对学校的领导、管理和服务，及时协调解决学校建设发展中遇到的问题。省有关部门要加大对贵州医科大学的支持力度，帮助改善办学条件、加快发展。
　　五、贵州医科大学要强化内部管理，着力加强内涵建设，努力提高教育教学质量、科研水平和办学效益，创新人才培养模式，促进学校办出特色和水平，更好地服务地方经济社会发展。